Os ônibus entram na Cidade Universitária de segunda a sexta das 05h00 à 00h30; aos sábados até as 14h00; e aos domingos, param na Portaria 1. Os pontos de ônibus municipais mais próximos da Bio são o da Rua Lago, do ICB e do Acesso à Vila Indiana. As linhas que passam nesses pontos são:

• 701U-10 METRÔ SANTANA/CIDADE UNIVERSITÁRIA

• 702U-10 TERM. PQ. D.PEDRO II/CIDADE UNIVERSITÁRIA

• 7725-10 RIO PEQUENO / TERMINAL LAPA

Há outros ônibus municipais que chegam à USP, mas não passam perto do Instituto. É possível usar uma destas linhas para chegar até a Cidade Universitária e, então, fazer uso de um circular. As linhas são:

• 177H-10 BUTANTA - USP/METRÔ SANTANA

• 177P-10 BUTANTA - USP/METRÔ SANTANA

• 7181-10 TERM. PRINC. ISABEL/CIDADE UNIVERSITARIA

• 7411-10 PÇA. DA SÉ/CID. UNIVERSITÁRIA

• 809U-10 METRÔ BARRA FUNDA/CID. UNIVERSITÁRIA

Os itinerários completos destas linhas podem ser obtidos no site da SPTrans, no link Itinerários. Todas as linhas vendem passagens dentro dos ônibus e elas custam R$ 5,00. 

Quatro linhas de circular trafegam dentro da Cidade Universitária, das quais três passam próximo ao IB-USP. São ônibus da SPTrans, com passagem custando R$ 5,00 e cujo ponto final é o terminal da Estação Butantã do Metrô. 

Vindo pela Marginal Pinheiros (sentido norte), pegue a ponte da Cidade Universitária, caindo na Rua Alvarenga. No segundo farol à direita está a entrada pela Portaria 1. Logo após a entrada, há um prédio de informações. Pergunte pelo Instituto de Biociências, na Rua do Matão. Descendo esta rua, o Instituto é o primeiro à esquerda.